De Bekemolen is een zogenaamde balie- of stellingmolen die hoger gebouwd is dan de gewone grondmolens. Bij deze stellingmolens werd rond de romp op een bepaalde hoogte een platform aangebracht van waarop de molenaar de kap en de wieken kan verdraaien. Men noemt dit type van molen ook « bovenkruier » of « hollander ». Functioneel gezien is het een korenwindmolen.           De molen heeft vijf verdiepingen, namelijk: de stapelzolder, de meelzolder, de steenzolder, de luizolder en de kapzolder. Een luizolder is de zolder waarop zich het luiwerk bevindt waarmee de zakken graan naar boven werden getrokken. De kap heeft een zogenaamd « wolfsdak », hetgeen typisch is voor de Oostvlaamse bovenkruiers.